그는 특히 “김준규 검찰총장은 한명숙 전 총리의 무죄판결을 책임지고 물러나는 게 마땅하다”며 “검찰은 철저한 상명하복체제인데, 검찰총장이 별건수사를 중단시키지 않으면 당력을 모아 검찰총장 퇴진에 모든 걸 걸겠다”고 압박했다.
또 “검찰이 반성과 성찰은커녕 날조된 기획조작수사로 제2의 한명숙 죽이기에 나섰다”며 “곽영욱 재판과 똑같이 구속된 사기범에 대한 강압 협박으로 사건을 날조하고 불법적으로 피의사실을 언론에 흘리는 방법으로 정치공작을 하고 있다”고 검찰을 비난했다.
이 원내대표는 “노무현 대통령을 죽음에 이르게 하고 한명숙 전 총리 무죄판결이 난 사건 과정에서 얼마나 큰 인격 파탄이 있었는지 잘 알 것”이라며 “검찰은 무죄판결 면피용으로 제2의 한명숙 죽이기, 피의사실 공표를 통해 명예를 실추시키는 것에 대해 통탄을 금하지 못한다”고 주장했다.
그는 “명백한 민주당에 대한 선거방해고 정치공작”이라며 “민주당의 유력한 서울시장 예비후보인 한명숙에 대한 이미지를 덧칠해서 어떻게든지 서울시장 선거에서 한나라당이 이길 수 있도록 한나라당을 도와주는 정치공작을 중단해야 한다”고 촉구했다.