한나라당은 “어떤 형태로든 노무현 색깔과 노무현 연고를 가진 사람이 특별히 대접받는 인사원칙이라면 그것은 국정이 아니고 사조직 운영에 불과하다”며 “이렇게 구성된 사법기관의 판결에 국민이 쉽게 승복하지 못한다면 그것은 전적으로 인사권자인 대통령 책임”이라고 지적했다.
한나라당은 “이번 검찰총장 인사는 또 노무현 대통령과 어떤 인연의 사람이 발탁되는지 궁금할 뿐”이라며 “가장 중립적이어야 할 사법부나 준사법부 인사에 대통령과의 인연이 가장 중시되는 이유는 단 한가지인데 정권에 의한 사법부와 검찰의 장악 더 솔직히 말하자면 정권의 예속화 때문”이라고 주장했다.
반면 참여연대는 이날 논평을 통해 “서열과 기수라는 기존 관행에서 벗어나고, 대법원 구성의 다양화라는 사회적 요청을 수용했다는 점에서 긍정적이라 본다”며 “이 같은 대법관 제청권 행사가 일회성으로 그칠 것이 아니라 앞으로도 이어져 하며, 다른 법원개혁 과제들도 일관되게 추진하길 요청한다”고 밝혔다.
참여연대는 그러나 “법원행정처 차장은 반드시 대법관이 된다는 관행이 이번에도 반복된 점은 아쉬움으로 남아 지적하지 않을 수 없다”고 덧붙였다.